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http://ciad.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1006/889| TRANSCRIPTOMA DE BRANQUIAS DE CAMARÓN BLANCO (Litopenaeus vannamei) INFECTADO CON EL VIRUS DE LA MANCHA BLANCA (WSSV) | |
| ALEJANDRA CLAVERO SALAS | |
| GLORIA MARTINA YEPIZ PLASCENCIA TERESA GOLLAS GALVAN Adriana Teresita Muhlia Almazan JORGE HERNANDEZ LOPEZ ROGERIO RAFAEL SOTELO MUNDO | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| COORDINACION DE TECNOLOGIA DE ALIMENTOS DE ORIGEN ANIMAL | |
| Las branquias son un tejido fisiológicamente importante en crustáceos y peces, son órganos multifuncionales encargados de la respiración, detoxificación y la regulación iónica y osmótica. Son un tejido clave para la respuesta al exterior y además, uno de los primeros tejidos en crustáceos que se infectan con el virus de la mancha blanca (WSSV). El entendimiento de los mecanismos que controlan la expresión genética como respuesta a diversos factores ambientales, es un prerrequisito para el mejor manejo y el progreso de la industria camaronícola. Por lo anterior, el primer paso es identificar los genes expresados en tejidos fisiológicamente importantes como las branquias, para posteriormente poder realizar estudios en genes específicos para proteínas clave en la supervivencia o adaptación a las condiciones de cultivo. La información sobre el transcriptoma de branquias de camarón es muy limitada; hasta· el momento, solo existen reportes de algunos genes que se expresan en este tejido. El objetivo de este trabajo fue investigar los genes expresados en las branquias de camarón blanco Litopenaeus vannamei infectado con el WSSV, mediante la utilización de un método de alta eficiencia. Este método combina la obtención y secuenciación masiva de clones de una genoteca de cDNA de branquias de camarón blanco infectado y el análisis bioinformático de las secuencias obtenidas; el cual comprende el ensamble e identificación de las secuencias mediante comparación con las bases de genes existentes. En este estudio se obtuvieron y secuenciaron 872 clones, alcanzándose 601 etiquetas de secuencias transcritas (ESTs, siglas en inglés) de calidad. El 67% de las secuencias fueron agrupadas en 79 conjuntos o "contigs" y el 33% restante permaneció como secuencias únicas o "singletons", obteniéndose un total de 276 secuencias diferentes. Éstas se clasificaron en cuanto a su función en 12 categorías, la's cuatro más abundantes fueron: 1) proteínas ribosomales con un 21 % del total, 2) proteínas sin homología a alguna proteína conocida y depositada en la base de datos con un 15%, 3) proteínas del WSSV, también con un 15%, y 4) proteínas hipotéticas con el 12%, las cuales incluyen secuencias novedosas que no han sido descritas en camarón. Además, se encontraron genes involucrados con la respuesta al estrés e inducidas en enfermedades, por lo que los transcritos encontrados reflejan la condición fisiológica del tejido y se infiere que la infección con WSSV podría ser la causa de la r | |
| 2006 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| Público en general | |
| BIOLOGÍA MOLECULAR | |
| Versión publicada | |
| publishedVersion - Versión publicada | |
| Aparece en las colecciones: | TESIS DE MAESTRÍA EN CIENCIAS. |
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