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http://ciad.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1006/462| USO DE LA DESCOMPOSICIÓN EN VALORES SINGULARES PARA EL ANÁLISIS DE CAMBIOS CONFORMACIONALES EN TIMIDILATO SINTASA | |
| ALDO ALEJANDRO ARVIZU FLORES | |
| ROGERIO RAFAEL SOTELO MUNDO ELISA MIRIAM VALENZUELA SOTO ANA MARIA CALDERON DE LA BARCA COTA MARIA MAYRA DE LA TORRE MARTINEZ ENRIQUE FERNANDO VELAZQUEZ CONTRERAS | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| La timidilato sintasa (TS) es la enzima objetivo de fármacos anticáncer como el fluorouracilo o antifolatos como el raltritrexed. Además, la TS es una proteína modelo donde se ha estudiado el cambio conformacional inducido por los fármacos, en busca de nuevos compuestos con mayor actividad biológica y menor toxicidad. Tradicionalmente, la cristalografía de rayos X se ha usado como la técnica por excelencia para determinar el cambio conformacional, pero las técnicas espectroscópicas como el dicroísmo circular permiten la caracterización en solución. El objetivo de este trabajo es evaluar el cambio conformacional en la TS de Escherichia coli inducido porB ligandos mediante descomposición en valores singulares (DVS) de espectros de dicroísmo circular (CD) y fluorescencia. Se colectaron espectros de dicroísmo circular y fluorescencia en timidilato sintasa de E. coli silvestre y mutante (K48Q) mediante titulación con el antifolato PDDF. Los resultados muestran que ocurre el cambio conformacional y se observan ligeras variaciones en CD que no pudieron ser identificadas mediante DVS. Utilizando fluorescencia de emisión de triptófano, se observó un efecto de apagamiento (quenching) asociado a la aparición de emisión a 379 nm. Los datos de fluorescencia fueron analizados mediante DVS y uno de los vectores resultantes se ajustó a un modelo de unión de ligandos de un sitio. La TS mutante K48Q de E. coli se utilizó como control, ya que se ha demostrado cristalográficamente que no une PDDF. El análisis mediante descomposición en valores singulares de datos obtenidos con técnicas espectroscópicas, complementa los estudios estructurales y permite evaluar el efecto de ligandos, inhibidores o sustratos en la conformación de proteínas. 1 | |
| 2006 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| Público en general | |
| QUÍMICA | |
| Versión publicada | |
| publishedVersion - Versión publicada | |
| Aparece en las colecciones: | TESIS DE MAESTRÍA EN CIENCIAS. |
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| Arvizu-Flores A A_MC_2006--.pdf | 11.2 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |