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http://ciad.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1006/152| CARACTERIZACIÓN DE LA COMUNIDAD BACTERIANA DEL CORAL POCILLOPORA CAPITATA DE LOS PARCHES CORALINOS DE MANZANILLO, COLIMA | |
| MARIA DE LOS ANGELES MILAGROS LAUREL SANDOVAL | |
| SONIA ARACELI SOTO RODRIGUEZ | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| Acuicultura y manejo ambiental | |
| Las principales comunidades arrecifales en la costa de Colima, México son La Boquita y Bahía Carrizales en donde las especies más abundantes pertenecen al género Pocillopora. La condicion de salud coralina de La Boquita ha sido reportada como en estado crítico de deterioro, contrario a Carrizales cuyo estado es aceptable; por lo cual el presente trabajo tiene como objetivo caracterizar las poblaciones microbianas del coral Pocillopora capitata de las dos áreas mediante la secuenciación del gen 16S ARNr. Se colectaron 18 fragmentos de tres condiciones de salud de cada localidad de acuerdo al criterio descrito en Coral Health Chart: coral enfermo (D2), intermedio (D4) y sano (D6) y se obtuvo una muestra de mucus y de pólipos de cada fragmento colectado. Se crearon librerías amplificando la región V3 del gen 16S ARNr con ADN metagenómico mediante el uso de marcadores moleculares acoplados a un código de barras para la identificacion de cada muestra. La secuenciacion de las librerías se llevó a cabo con ayuda del secuenciador masivo PGM de Ion Torrent® (Life Technologies). El análisis bioinfomático de las secuencias se realizó con el programa QIIME y RDP Classifier y se clasificaron en unidades taxonómicas operacionales (OTUs). La asignación taxonómica se empleó para calcular los índices ecólogicos y hacer comparaciones múltiples entre la condición de salud, el tipo de muestra y el sitio de muestreo mediante el uso de los programas. Se obtuvieron 906,563 lecturas de 158 pb en promedio. El género estadísticamente más abundante fue Serratia en muestras de mucus y en estadio D2, además de Burkholderia, Chlorobium y Francisella. La mayor diversidad se encontró en organismos en D4 y la menor diversidad en D2. Este trabajo representa el primero de su tipo y sienta las bases para estudios futuros. Palabras clave: Pocillopora capitata, comunidad microbiana,16S ARNr, secuenciación masiva, arrecife coralino, salud coralina. | |
| Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C. | |
| 31-01-2014 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| Nacional e internacional | |
| Público en general | |
| CIENCIAS DE LA VIDA | |
| Versión publicada | |
| publishedVersion - Versión publicada | |
| Aparece en las colecciones: | TESIS DE MAESTRÍA EN CIENCIAS. |
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