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http://ciad.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1006/1397| ESTUDIO DE LA REGULACIÓN EN LA EXPRESIÓN GÉNICA EN EMBRIONES CIGÓTICOS DE VID (Vitis vinífera L.) DURANTE LA CRIOCONSERVACIÓN | |
| MARIANA QUIJADA RIVERA | |
| MARISELA RIVERA DOMINGUEZ | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| La vid (Vitis vinifera L.) es un cultivo de importancia mundial desde el punto de vista económico y gastronómico. Debido a esto, es importante aplicar metodologías para la conservación de su germoplasma. La crioconservación es una técnica para el almacenamiento de recursos fitogenéticos, que expone los tejidos a diferentes tipos de estrés abiótico que puede conducir a cambios fenotípicos y genómicos. Sin embargo, existe poca información acerca del mecanismo molecular de respuesta de los embriones de uva al tratamiento de crioconservación. En consecuencia, el objetivo del presente estudios fue obtener el transcriptoma de embriones cigóticos de uva tratados con el procedimiento de crioconservación. El ARN se obtuvo embriones de semillas de uva cv. Red Globe expuestos a la solución vitrificante PVS2 y a la solución PVS2 en combinación con congelación nitrógeno líquido y posterior descongelación rápida. La secuenciación se realizó en Illumina NextSeq 500. La alineación promedio de lecturas fue del 96% frente al genoma de referencia. Los perfiles de expresión mostraron 229 genes expresados diferencialmente por procedimiento de crioconservación de los cuales 186 fueron reprimidos y 46 inducidos. Los principales procesos biológicos que mostraron enriquecimiento en los genes inducidos fueron ensamblaje de nucleosomas y regulación negativa del crecimiento de órganos. Por otro lado, los procesos que mostraron enriquecimiento de genes reprimidos fueron los relacionados con organización de la pared celular y componentes de la membrana. El análisis del transcriptoma mostró que dentro de los genes expresados diferencialmente se encuentran mayormente inducidos el producto proteico sin nombre (ID:VIT_01s0146g00320) que es componente integral de membrana y proteína de choque térmico 17,3 kDa clase II (ID:VIT_04s0008g01550). Dentro de los reprimidos se encuentra la ATPasa subunidad 1 (ID:VIT_00s0733g00010) y Expansina-A1 (ID:VIT_01s0026g02620). La validación del transcriptoma se logró utilizando los cuatro genes mencionados. Los resultados obtenidos indican cambios en la transcripción de genes posiblemente relacionados con procesos epigenéticos y con el aumento en la reserva de nutrientes. | |
| 16-12-2021 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA | |
| Aparece en las colecciones: | TESIS DE MAESTRÍA EN CIENCIAS. |
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