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CARACTERIZACIÓN GENÓMICA DE CEPAS DE Salmonella spp. AISLADA DE HECES DE ANIMALES
HILARY ARIM BELTRAN SAUCEDA
CRISTOBAL CHAIDEZ QUIROZ
Acceso Abierto
Atribución-NoComercial-SinDerivadas
Las bacterias del género Salmonella son uno de los principales microorganismos causantes de infecciones gastrointestinales en los humanos con mayor morbilidad y mortalidad en el mundo. El género Salmonella se compone de dos especies, Salmonella bongori y Salmonella enterica; de esta última se reportan más de 2600 serotipos capaces de infectar a humanos y animales de sangre fría y caliente, razón por la cual Salmonella enterica se encuentra en una vigilancia epidemiológica mundial. En México, la circulación de serotipos de Salmonella es alta, y Sinaloa se encuentra en los primeros lugares de prevalencia de salmonelosis, por lo que su aislamiento y caracterización ayudará a conocer los serotipos más prevalentes en la región. Por lo tanto, el presente estudio tuvo como objetivo aislar y caracterizar cepas de Salmonella de heces de animales de granja en la región del Valle de Culiacán. El análisis consistió en 77 muestras de heces de animales de granja que corresponden a 36 de vaca, 14 de gallina y 27 de cerdo y fueron recolectadas en seis sitios de muestreo en el período de diciembre de 2019 a marzo de 2021. Como resultados, se obtuvieron colonias presuntivas utilizando medios de cultivo semi-selectivos y selectivos. La confirmación de las colonias presuntivas de Salmonella se realizó mediante la prueba de reacción en cadena de la polimerasa y posteriormente fueron sometidas a la secuenciación del genoma completo por medio del dispositivo MinION (Oxford, Nanopore Technologies). Del total de 77 muestras analizadas el 32.4% (25/77) fueron positivas para Salmonella y se identificaron 4 serovariedades, donde S. Weltevreden (25%), S. Thipymurium (14%), S. Havana (12%) y S. Sandiego (11%) fueron los serotipos más frecuentes. Los nueve aislados seleccionados para secuenciación tuvieron un tamaño de genoma entre 4,941,109 a 5,583,603 pb y un contenido de G+C de 48-52%. Con un tamaño del genoma desde 4,941,109 a 5,583,603 pb y un contenido de G+C 48-52%. Se encontraron 34 genes de resistencia antimicrobiana en los 9 genomas y a su vez, todos los serotipos presentaron las islas de patogenicidad SPI-1, SPI-2 y SPI-3. Este estudio proporciona información sobre la distribución de la población de Salmonella en animales de granja, así como la generación de registros de los serotipos circulantes en la región y su contenido genético.
02-09-2022
Tesis de maestría
Español
BIOLOGÍA Y QUÍMICA
Aparece en las colecciones: TESIS DE MAESTRÍA EN CIENCIAS.

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