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http://ciad.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1006/1321| CARACTERIZACIÓN GENÓMICA DE CEPAS DE Escherichia coli Y Klebsiella spp AISLADAS EN LA CADENA DE PRODUCCIÓN DE FRESA EN CULIACÁN, SINALOA | |
| ANGEL IBARRA RODRIGUEZ | |
| CRISTOBAL CHAIDEZ QUIROZ | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| La producción de fresa en Culiacán, Sinaloa, es una importante actividad económica del sector agrícola. La mayor parte de la producción se realiza en plantíos de una hectárea, ubicados a orillas del río Culiacán y de los canales de riego que de éste derivan, inclusive dentro del área urbana. La ubicación y manejo del cultivo, las características del fruto, así como su consumo en fresco hacen de las fresas un potencial vehículo de bacterias entéricas como las del grupo Coliformes de las que algunas especies podrían ocasionar infecciones gastrointestinales. El objetivo de este trabajo fue determinar la presencia de bacterias coliformes en diferentes matrices en la cadena de producción de fresa, caracterizar su fenotipo y genotipo (factores de virulencia, genes de resistencia a antibióticos), y determinar si éstas representan un riesgo al consumidor. Para ello se analizaron 25 muestras en total, incluyendo agua de irrigación, fruto precosecha, manos durante cosecha, recipientes y fruto en venta. Se realizó la evaluación de resistencia a antibióticos mediante la prueba de difusión en disco, cinco aislados fueron seleccionados para secuenciación de genoma completo y se utilizaron herramientas bioinformáticas del servidor del Centro de Epidemiologia Genómica (CGE) de la Universidad Técnica de Dinamarca para la caracterización in silico de los genomas. Posteriormente se construyó el pangenoma con el programa anvio v6.2 y se elaboraron árboles filogenéticos. Del total de 25 muestras analizadas el 64 % (16/25) presentó coliformes totales (CT), y el 56 % (14/25) coliformes fecales (CF). Las concentraciones de CT variaron desde 9.1 NMP/g en fruto en venta hasta 2,5x105 NMP/100mL en agua de irrigación. Los CF variaron desde 3 NMP/g en fruto en venta, hasta 2.4 x105 NMP/100mL en agua. Los aislados A3a, A4b, S4b se identificaron como E. coli serotipos O17/O77:H18, O111:H4 y H14, respectivamente. Los aislados M4g y Fv4a se identificaron como Klebsiella pneumoniae y Klebsiella quasipneumoniae, respectivamente. Todas las cepas presentaron resistencia a ampicilina; los aislados A3a y A4b presentaron resistencia a tetraciclina y ciprofloxacino. El pangenoma estuvo constituido por 7811 genes en E. coli y 9316 en Klebsiella. De acuerdo con el programa PathogenFinder los aislados A3a, A4b, S4b, M4g, Fv4a tienen una probabilidad de ser patógenos para el humano de 0.936, 0.936, 0.946, 0.755 y 0.855, respectivamente. | |
| 27-01-2022 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| BIOLOGÍA Y QUÍMICA | |
| Aparece en las colecciones: | TESIS DE MAESTRÍA EN CIENCIAS. |
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