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http://ciad.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1006/1317| VIAS MOLECULARES ASOCIADAS A LA TOLERANCIA AL ESTRÉS POR UV-B EN Capsicum annuum L. | |
| ESTEFANIA ESPINOZA BOJORQUEZ | |
| JOSEFINA LEON FELIX | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| El pimiento morrón (Capsicum annuum L.) es considerado una solanácea de importancia económica y de gran valor nutricional. Sin embargo, su producción puede estar limitada por factores abióticos como la radiación UV-B, que genera daños y cambios morfológicos, fisiológicos, bioquímicos y moleculares. Los genomas de referencia con conjuntos de datos masivos de transcriptomas de varias condiciones ambientales nos dan información acerca de los eventos moleculares que pueden proveer pistas para inferir sobre procesos fisiológicos que podrían contribuir a la adaptación del cultivo. Los cambios moleculares se pueden medir con la técnica ARN-Seq, que permite identificar y medir cambios en la expresión génica, proporcionando información sobre los genes que participan en la respuesta al estrés. Sin embargo, se han publicado pocos perfiles de expresión génica para examinar los mecanismos de respuesta a estrés ambiental en pimiento. Por lo que el objetivo de esta investigación fue determinar el perfil de los genes que se expresan en el pimiento morrón (C. annuum L.) en respuesta al estrés por radiación UV-B, para ello, se obtuvieron datos de secuenciación masiva de ARN de muestras de tallo de plantas C. annuum cv. Cannon, a las 0, 3 y 25 h después de exposición a radiación UV-B. Los datos de secuenciación masiva obtenidas por ARN-seq se procesaron con los programas bioinformáticos: Fastq joiner, Fastq interlacer, FastQC, Trimmomatic, Hisat2, HTSeq-count, Deseq2, R Studio, las plataformas PantherGO y KEGG. Mediante dichos programas se verificó y filtró la calidad de las secuencias, se mapearon con un genoma de referencia, se cuantificaron e identificaron los genes diferencialmente expresados y se realizó la ontología de genes y anotación funcional. Como resultado se obtuvieron un total de 141 y 118 genes expresados diferencialmente a las 3 y 25 h, según la metodología estadística de distribución binomial negativa y una corrección FDR (α = 0.05 y LFC = ±1.5). La anotación funcional se realizó con un análisis estadístico basado en la prueba de Fisher y ajuste FDR (α = 0.05), indicando que los genes están asociados con el ritmo circadiano de la planta, metabolismo de tiamina, metabolismo de sulfuro, procesamiento de proteínas en el retículo endoplasmático, fotosíntesis, endocitosis y espliceosoma. Se observó que los genes están relacionados con funciones como señalización del estrés, respuesta a estímulos y regulación de la función biológica. | |
| 28-01-2022 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| BIOLOGÍA Y QUÍMICA | |
| Aparece en las colecciones: | TESIS DE MAESTRÍA EN CIENCIAS. |
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