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http://ciad.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1006/1300| INTERACCIONES ANTAGONISTAS ENTRE Bacillus spp. DE UNA COMUNIDAD SINTÉTICA MODELO DE CUATROCIÉGENAS, COAHUILA | |
| VALERIA GUZMAN MELLADO | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| La laguna Churince es un sistema acuático oligotrófico ubicado en Cuatrociénegas, México, en donde la microbiodiversidad es estable espacial y temporalmente; por lo tanto, las comunidades microbianas en este hábitat están compuestas por linajes antiguos y son de interés científico. Utilizando estrategias de ecología sintética para el estudio de Bacillus spp., se ha encontrado que el ensamblaje de las comunidades de sedimento en Churince está mediado por interacciones antagonistas, relacionadas con su capacidad para producir metabolitos secundarios tóxicos. En la comunidad sintética BARS (Bacillus Antagonista, Resistente, Sensible) la interacción de antagonismo entre la cepa Bacillus pumilus Bp145 (antagonista) y la cepa Sutcliffiella horikoshii Sh20a (sensible), se ve atenuada por la presencia de la cepa Bacillus cereus Bc111 (resistente). En este trabajo se exploran las bases genéticas y moleculares que median el antagonismo en esta comunidad. En la primera etapa, se realizó un análisis de genómica comparativa entre cepas filogenéticamente cercanas a Bp145, identificando clusters genéticos para la biosíntesis (BGC: Biosynthetic Gene Cluster) de antibióticos. En una segunda etapa se sustituyó a Bp145 por las cepas cercanas en confrontaciones dobles con Sh20a para determinar equivalencia ecológica, buscando correlacionar la presencia de clusters con la capacidad antagonista de cepas de B. pumilus. En una última etapa se caracterizó el BGC y el metabolito candidato mediante línea de comandos y Machine Learning para definir su actividad biológica. De acuerdo al perfil de BGC, todas las cepas tienen clusters de síntesis de antibióticos identificados como fengicina, liquenisina, bacilisina, bacilibactina y zwitermicina (Bp-ZmA-Like). Con base en las cepas que resultaron ecológicamente equivalentes a Bp145 (Bp144 y Bp150), se identificó a Bp-ZmA-Like como el cluster candidato para mediar la interacción, pues solo está presente en las cepas equivalentes y no en las demás. Este cluster biosintetiza un metabolito secundario aún no descrito, que es una combinación entre un policétido-péptido no ribosomal que tiene una probabilidad del 64% de tener actividad anti Gram positiva. La generación de conocimiento sobre los mecanismos que rigen las interacciones en las comunidades microbianas es indispensable para el entendimiento del papel de la microbiodiversidad en el adecuado funcionamiento de los ecosistemas. | |
| 19-09-2022 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| BIOLOGÍA Y QUÍMICA | |
| Aparece en las colecciones: | TESIS DE MAESTRÍA EN CIENCIAS. |
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