Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem:
http://ciad.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1006/1295| ANÁLISIS INTEGRAL DE LA CAPACIDAD DE VIRULENCIA DE Salmonella Oranienburg DE ORIGEN CLÍNICO Y AMBIENTAL | |
| EDEN SALENKO GUERRERO SOTO | |
| NOHELIA CASTRO DEL CAMPO | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| Salmonella es uno de los principales agentes infecciosos que causan enfermedades diarreicas a nivel mundial vinculado al consumo de alimentos contaminados. Dentro de los vehículos de contaminación por Salmonella se encuentran los cuerpos de agua; este ambiente expone a Salmonella a condiciones de estrés (temperatura, radiación solar, salinidad, depredación y agentes químicos) que repercuten en la capacidad de crecimiento, supervivencia, virulencia y resistencia a antimicrobianos (AMR) de la bacteria. En Sinaloa, Salmonella Oranienburg es uno de los serotipos mayormente encontrados en matrices ambientales y las investigaciones realizadas se han centrado en determinar la capacidad de infección y producción de biopelículas de S. Oranienburg de origen ambiental y clínico. Sin embargo, se desconoce su perfil AMR y es necesario estudiar con mayor profundidad sus características genéticas para conocer el potencial de patogenicidad y AMR, dependiendo de su fuente de aislamiento. El objetivo del presente proyecto fue determinar el perfil fenotípico de AMR y caracterizar genotípicamente la capacidad patogénica de Salmonella Oranienburg de origen clínico (S-347) y ambiental (S-76). La prueba de susceptibilidad antimicrobiana se realizó mediante el método de difusión en disco Kirby-Bauer y 22 antibióticos de diez clases diferentes. Se secuenció la cepa S-347 y se anotaron los genomas de S-347 y S-76 mediante los programas RAST y Prokka para determinar el perfil genómico. Se identificaron los genes específicos para AMR utilizando los programas ABRicate y ResFinder, los genes para formación de biopelícula mediante RAST y Prokka, y las islas de patogenicidad con la herramienta NCBI-BLASTn. Se determinaron los genes únicos con el programa Roary, a fin de encontrar diferencias intraserotipo. Los resultados de AMR en laboratorio mostraron que las cepas S-76 y S-347 fueron susceptibles a los 22 antibióticos evaluados. La longitud del genoma de S-347 (5.0 Mpb) fue 9 % mayor que S-76 (4.6 Mpb), dotándola de más secuencias codificantes (CDS): 5,087 CDS para S-347 y 4,498 CDS para S-76. Se obtuvo el mismo número de genes relacionados con virulencia, defensa y producción de biopelícula (108 genes) en los genomas de S-347 y S-76. Ambos genomas presentaron 8 genes codificantes para bombas de eflujo relacionados con AMR, a excepción del gen mdtA ausente en S-347. | |
| 26-01-2022 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| BIOLOGÍA Y QUÍMICA | |
| Aparece en las colecciones: | TESIS DE MAESTRÍA EN CIENCIAS. |
Cargar archivos:
| Fichero | Tamaño | Formato | |
|---|---|---|---|
| Edén Salenko Guerrero Soto.pdf | 3.17 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |