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PERFIL METAGENÓMICO DE COMUNIDADES BACTERIANAS EN AGUA SUPERFICIAL DEL VALLE DE CULIACÁN
KIMBERLY PAOLA HERNANDEZ AGUAYO
CRISTOBAL CHAIDEZ QUIROZ
Acceso Abierto
Atribución-NoComercial-SinDerivadas
Las bacterias representan un grupo microbiano abundante y esencial de los ecosistemas acuáticos. Sin embargo, la diversidad bacteriana es muy variable y depende de factores ambientales, geográficos y fuentes de contaminación. Esta última, modifica y compromete la calidad de los cuerpos de agua superficial mediante la introducción de bacterias patógenas, con potenciales riesgos para la población. La regla de oro para verificar la ausencia de bacterias patógenas en agua de uso agrícola es mediante la medición de bacterias indicadoras. Sin embargo, su utilización es altamente cuestionada ya que no detecta directamente a las bacterias patógenas y tampoco permiten determinar la prevalencia de grupos bacterianos. Especialmente, identificar bacterias patógenas resulta importante ya que el agua puede actuar como vehículo de enfermedades diarreicas, las cuales son una de las diez principales causas de muerte a nivel mundial y segunda causa de muerte de niños menores de cinco años. Debido a la importancia que representan las fuentes de agua en el Valle de Culiacán, particularmente en el sector agrícola, se requiere profundizar en la identificación de los grupos bacterianos más prevalentes con técnicas robustas y confiables. Para contribuir con ello, el objetivo de la presente investigación fue determinar la composición de las comunidades bacterianas presentes en agua superficial, empleando análisis metagenómico (secuenciación y análisis del gen ARNr 16S) de 17 muestras pertenecientes a cinco sitios (río y canales de riego agrícola), asignadas taxonómicamente con la base de datos SILVA y el programa Centrifuge. Como resultado de todas las muestras, se obtuvieron 2.7 M de lecturas, asignadas a 2862 taxones, una diversidad máxima de 4.66 (río) y una mínima de 3.16 (canal) de acuerdo al índice de Shannon. Se identificó una comunidad bacteriana dominada por los filos Proteobacteria, Bacteroidetes y Actinobacteria en río y canales de riego agrícola. También se demostró la presencia de géneros que contribuyen a una buena salud del ecosistema, como Dinghuibacter, Polynucleobacter, CL_500_29 y Limnohabitans. Adicionalmente, se identificaron 37 patógenos, entre los que destacan Aeromonas, Clostridium sensu stricto 1, Pseudomonas y Legionella, y en menor proporción se recuperaron secuencias asignadas a Salmonella y E. coli.
19-01-2022
Tesis de maestría
Español
BIOLOGÍA Y QUÍMICA
Aparece en las colecciones: TESIS DE MAESTRÍA EN CIENCIAS.

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