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http://ciad.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1006/1289
ESTUDIO DE LA VARIABILIDAD GENÉTICA DE SALMONELLA ORANIENBURG EXPUESTA A AGUA DE RÍO | |
MANUEL ANGEL CASTILLO OLEA | |
NOHELIA CASTRO DEL CAMPO | |
Acceso Abierto | |
Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
Salmonella es uno de los principales patógenos causantes de enfermedades gastrointestinales a nivel mundial. Al igual que la mayoría de las bacterias, las especies de Salmonella cursan procesos adaptativos (fenotípicos y genotípicos), particularmente en su fase ambiental de donde obtiene beneficios en compensación a los estímulos que recibe a lo largo de su ciclo de vida. En las fuentes de agua superficial (ríos y canales) de los municipios de Culiacán y Navolato, en el estado de Sinaloa, se documentó una alta prevalencia de distintos serotipos de Salmonella, los cuales sufren cambios genéticos que podrían ayudar a su supervivencia en ambientes no hospedantes. Sin embargo, a falta de información sobre el papel que juega el agua en los procesos evolutivos de Salmonella hace de este tema un área de oportunidad en la ciencia. En este trabajo, se buscó evaluar el efecto del agua de rio sobre la tasa y espectro mutacional de Salmonella a través del tiempo. Para ello se realizó la exposición durante 3 meses en agua de río de dos cepas de Salmonella Oranienburg, un aislado ambiental (S76) y un aislado clínico (S347), en el río Humaya contenidas en capsulas de supervivencia. Las cápsulas de supervivencia se recolectaron durante 30 días y se trasladaron de manera aséptica al LANIIA donde se extrajo el ADN. Algunas cepas de Salmonella fueron secuenciadas para evaluar las variantes acumuladas en el tiempo, por medio del llamado de variantes utilizando los programas bioinformáticos SAMTOOLS 1.8 y SNPeff 4.4. Los resultados obtenidos mostraron la acumulación de 215 mutaciones para Salmonella Oranienburg S347 durante 30 días de exposición y una tasa de mutación de 2.10 x10-8 a 1.96 x10-9 mutaciones por sitio por generación; para el caso de Salmonella Oranienburg S76-1 se encontraron un total de 351 mutaciones y una tasa de 4.1 x10-8 a 2.23 x10-8 durante 5 días de exposición al ambiente y se encontraron mutaciones en los genes MutL y MutY, los cuales están relacionados con la generación de fenotipos hipermutantes de Salmonella. En conclusión, estos resultados sugieren que las cepas analizadas cuentan con la capacidad genética para generar un fenotipo hipermutante y que son capaces de alterar su tasa de mutación para persistir en el ambiente. Se recomienda llevar a cabo el análisis de cepas silenciadas para los genes que presentaron mutaciones, en particular los relacionados a reparación de ADN para esclarecer su impacto en la supervivencia en ambientes acuáticos. | |
26-01-2022 | |
Tesis de maestría | |
Español | |
BIOLOGÍA Y QUÍMICA | |
Aparece en las colecciones: | TESIS DE MAESTRÍA EN CIENCIAS. |
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