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http://ciad.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1006/1251| IDENTIFICACIÓN Y CARACTERIZACIÓN DE PSEUDOGENES DE Salmonella enterica AISLADA DEL RIO CULIACÁN | |
| KARLA MARIA SANDOVAL RAMOS | |
| CRISTOBAL CHAIDEZ QUIROZ | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| En bacterias, los pseudogenes son secuencias de ADN no funcional similares a genes funcionales, se originan durante el curso de la evolución mediante mutaciones puntuales en regiones reguladoras y marcos de lectura abiertos (ORF). A pesar de que los pseudogenes son escasos en genomas bacterianos, la pseudogenización se considera un proceso importante en el que ciertos genes se vuelven dispensables durante la colonización de un nuevo nicho ecológico. Este proceso puede considerarse como adaptativo para las bacterias y, además, puede fungir como un registro de la historia evolutiva del organismo. Por esta razón, es de interés determinar el papel que tienen los pseudogenes en la adaptación ambiental de este patógeno. Para lograrlo, 84 secuencias genómicas de Salmonella enterica pertenecientes a los serotipos Weltevreden (n=7), Saintpaul (n=37) y Oranienburg (n=40) aislados del rio Culiacán fueron analizadas con el algoritmo Psi-Phi; comparando las secuencias de nucleótidos de cada genoma objetivo contra la secuencia de proteínas anotadas de un genoma de consulta para cada serotipo. Los criterios de evaluación fueron porcentaje de identidad (<80%), e-value (<10𝑒−15 ) y la presencia de mutaciones en regiones reguladoras. Se lograron anotar un total de 94, 62 y 24 pseudogenes en los serotipos Oranienburg, Saintpaul y Weltevreden, respectivamente. De igual manera, se identificaron 25 categorías COG (Cluster of Orthologous Group) presentes en los genes asociados a pseudogenes en los cuales predominó la ausencia de categoría COG (31.56%) ,seguido de la categoría asociada a traducción, estructura ribosomal y biogénesis (10.30%), producción y conversión de energía (9.97%), transporte y metabolismo de carbohidratos (7.97%), modificaciones postraduccionales, modificaciones de proteínas y chaperonas (7.64%); las cuales se ven implicadas en el metabolismo y reparación de ADN, por lo que de acuerdo con los resultados obtenidos se puede inferir que los perfiles de pseudogenización identificados en los aislados ambientales de Salmonella enterica proporcionan una valiosa huella adaptativa y evolutiva. Estos pseudogenes, que se originan a través de mutaciones en regiones reguladoras y ORF, así como otros mecanismos, pueden representar una estrategia adaptativa para las bacterias en un nuevo nicho ecológico. | |
| 07-12-2023 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| BIOLOGÍA Y QUÍMICA | |
| Aparece en las colecciones: | TESIS DE MAESTRÍA EN CIENCIAS. |
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