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http://ciad.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1006/1221| ANÁLISIS DEL TRANSCRIPTOMA DEL EXOCARPO DE FRUTO DE PITAYA (Stenocereus thurberi) Y DE LA COMPOSICIÓN DE CUTÍCULA | |
| Heriberto García Coronado | |
| Martín Ernesto Tiznado Hernández | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| Stenocereus thurberi es un cactus endémico del Desierto de Sonora que produce un fruto llamado pitaya. En frutos, la cutícula regula la pérdida de agua durante el desarrollo y la post-cosecha. Con el objetivo de elucidar el mecanismo molecular de biosíntesis de cutícula de pitaya, se obtuvo el transcriptoma de exocarpo de pitaya de frutos en estado maduro y sobremaduro en condiciones naturales mediante secuenciación de la nueva generación (Next Generation Sequencing [NGS]). El ensamblaje de novo de las secuencias cortas se realizó mediante el software Trinity. Se marcaron flores abiertas de pitaya y se obtuvieron frutos con 10, 20, 30, 35 y 40 días después de floración (DDF). En el exocarpo del fruto, se realizó la extracción química y cuantificación gravimétrica de los componentes cuticulares cutina y ceras. Asimismo, se identificaron transcritos relacionados con la biosíntesis de cutícula y genes de referencia para la cuantificación de la expresión relativa. El ensamblaje se realizó a partir de 243 millones de secuencias cortas con un tamaño de 80-150 pares de bases. En total se ensamblaron 174,449 transcritos con N50 de 2,110 pb. La anotación funcional de los transcritos se realizó utilizando las bases de datos Swiss-Prot, RefSeq, nr-NCBI, PlantTFDB, iTAK, TAIR e ITAG. Del total de transcritos, 122,234 (70.07%) fueron clasificados como codificantes y 43,391 fueron clasificados como ARN largos no codificantes. Se identificaron los genes de referencia factor de elongación 1-alfa (StEF1a), alfa-tubulina (StTUA) y poliubiquitina 3 (StUBQ3). En frutos maduros con 40 DDF, se observó mayor cantidad de cutina y menor cantidad de ceras. La expresión de los transcritos acil-CoA de cadena larga sintetasa 2 (StLACS2), cetoacil-CoA sintetasa 2 (StKCS2) y enoil-CoA reductasa (StECR) mostraron una correlación positiva con la acumulación de ceras totales. Contrariamente, para cetoacil-CoA sintetasa 6 (StKCS6), el transportador tipo ABC miembro 11 de la familia G (StABCG11) y eceriferium 3 (StCER3) la expresión aumentó en fruto con 40 DDF. Los resultados sugieren cambios en la longitud de la cadena de los componentes cuticulares y composición de cutícula durante la maduración del fruto. La información generada apoyará futuros experimentos con el objetivo de elucidar el mecanismo de biosíntesis de cutícula en frutos pitaya y otros cactus. | |
| 06-10-2023 | |
| Tesis de doctorado | |
| Español | |
| CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA | |
| Aparece en las colecciones: | TESIS DE DOCTORADO EN CIENCIAS (DC) |
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