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http://ciad.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1006/1074| ANÁLISIS DEL GENOMA Y GENES DEL MECANISMO DE INFECCIÓN DE LA BACTERIA CAUSANTE DE LA NECROSIS HEPATOPANCREÁTICA EN CAMARONES | |
| JUAN MANUEL LEYVA | |
| TERESA GOLLAS GALVAN JESUS HERNANDEZ LOPEZ ARMANDO FRANCISCO VARGAS ALBORES | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| Tecnología de alimentos de origen animal | |
| a necrosis hepatopancreática (NHP) es causada por una bacteria Gram-negativa, pleomórfica, intracelular, que infecta el epitelio del hepatopáncreas de camarón. Debido a la falta de medios para el cultivo in vitro, se dificulta estudiar el ciclo de vida de esta bacteria y, entre otras cosas, se desconocen los mecanismos que utiliza en el proceso de infección. Por ello, el objetivo del trabajo fue analizar el genoma de NHP-B, y proponer un modelo del mecanismo de infección; para lo cual, se extrajo el ADN genómico de NHP-B, previamente aislada de hepatopáncreas de camarones infectados. Con el ADN se prepararon las genotecas a secuenciar, posteriormente se realizó un ensamble de novo y se predijeron las secuencias codificantes (CDS) para el análisis de identidad. Se obtuvo un genoma de 1.19 Mpb, con un contenido de GC de 49.62 %, y una profundidad de 30.15 veces. Se identificaron el 48 % de las 1449 CDS, los datos genómicos se encuentran en proceso para la asignación de un número de referencia, referente al BioProject (PRJNA507068) y BioSample (SAMN10484491). Además, se identificaron genes relacionados con la patogenicidad de la bacteria, como los relacionados con el flagelo y pili tipo I y IV, la presencia de la adhesina OmpA, los sistemas de secreción tipo I, II, y VI, hemolisina C y fosfolipasa. El genoma presenta un alto contenido de GC, que es atribuido al estrés del ambiente marino y forma parte de su adaptación evolutiva, al igual que algunos factores de virulencia como el flagelo. Por otro lado, la identificación de los genes relacionados con el proceso de infección representa un avance en la comprensión de la relación patógeno-hospedero que en esta bacteria se desconocía debido a las características intracelulares de NHP-B. Sin embargo, gracias a las nuevas tecnologías de secuenciación, la genómica representa una oportunidad para el onocimiento de los procesos de infección y así en un futuro, poder establecer estrategias para el estudio y el control de infecciones por esta bacteria.. | |
| Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C. | |
| 2018 | |
| Tesis de doctorado | |
| Español | |
| Beneficiarios de fondos federales y solicitantes Bibliotecarios Empresas Estudiantes Investigadores Medios de comunicación Proveedores de fondos para estudiantes Público en general | |
| BIOLOGÍA MOLECULAR | |
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| Aparece en las colecciones: | TESIS DE DOCTORADO EN CIENCIAS (DC) |
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