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http://ciad.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1006/1073| ANÁLISIS TRANSCRIPTÓMICO Y ESTABILIDAD GENÉTICA DE LA CRIOCONSERVACIÓN DE VID (Vitis vinifera L.) | |
| María Fernanda Lazo Jalavera | |
| MARISELA RIVERA DOMINGUEZ Martín Ernesto Tiznado Hernández Irasema del Carmen Vargas Arispuro | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| Ciencia de los alimentos | |
| La vid (Vitis vinifera L.) es considerada uno de los cultivos más importantes económicamente en México, y en el estado de Sonora que es el líder en producción y exportación de uva de mesa. Sin embargo, este cultivo puede ser afectado por factores bióticos y abióticos que pueden inducir alteraciones fenotípicas. Por esa razón, es importante aplicar nuevos métodos para preservar el germoplasma de vid. La crioconservación es una alternativa muy eficiente para la conservación el germoplasma vegetal. Esta técnica consiste en el almacenamiento de material biológico en nitrógeno líquido (NL). Los protocolos de crioconservación han sido optimizados para diversos tejidos vegetales; sin embargo, éstos pueden causar estrés físico, químico, fisiológico, y a su vez provocar cambios en la estabilidad genómica y/o expresión génica. Por ello, el objetivo de este estudio fue el de establecer un protocolo de crioconservación de vid, analizar los efectos del tratamiento en la estabilidad genómica y el transcriptoma mediante la secuenciación masiva del ARN. Se evaluaron las técnicas de vitrificación y encapsulación-deshidratación en yemas axilares de vid cv. Flame seedless a través de la regeneración, viabilidad y la estabilidad genómica. De igual forma, se realizó la secuenciación del transcriptoma de embriones cigóticos de vid cv. Red Globe crioconservados mediante vitrificación utilizando el sistema NextSeq 500 de Illumina. Nuestros resultados mostraron que el mejor método para la crioconservación de yemas axilares fue empleando la vitrificación con las soluciones crioprotectoras PVS2 por 60 min y PVS3 por 120 min, obteniendo en promedio un 30% de viabilidad de los tejidos. Se obtuvo 50% de regeneración en embriones cigóticos posterior al almacenamiento en NL. El número total de lecturas obtenidas fue de aproximadamente 600 millones (~45Gb secuenciadas). El promedio de lecturas alineadas al genoma de referencia de vid cv. Pinot Noir fue del 90%. Los embriones respondieron a la exposición con PVS2 mediante la inducción de la expresión de 93 genes, así como reprimiendo 144 genes, y después del almacenamiento en NL se encontraron solamente 12 genes inducidos y 194 reprimidos respecto a la muestra control. En el análisis funcional de los genes diferencialmente expresados durante la crioconservación se encontraron diversas respuestas, incluyendo la activación de rutas del metabolismo secundario, respuestas al estrés oxidativo y proteínas de la pared celular. | |
| Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C. | |
| 2018 | |
| Tesis de doctorado | |
| Español | |
| Público en general | |
| BIOQUÍMICA DE ALIMENTOS | |
| Versión publicada | |
| publishedVersion - Versión publicada | |
| Aparece en las colecciones: | TESIS DE DOCTORADO EN CIENCIAS (DC) |
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