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ADNc’s diferencialmente expresados en Alternaria alternata tolerante a 2-propenil-isotiocianato
MARIA ELENA BAEZ FLORES
Martín Ernesto Tiznado Hernández
ROSALBA TRONCOSO ROJAS
María Auxiliadora Islas Osuna
MARISELA RIVERA DOMINGUEZ
MARTIN CANDELARIO ESQUEDA VALLE
Acceso Abierto
Atribución-NoComercial-SinDerivadas
COORDINACIÓN DE TECNOLOGÍA DE ALIMENTOS DE ORIGEN VEGETAL
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EI desarrollo de cepas de hongos resistentes a fungicidas sintéticos es un problema en agricultura que destaca en necesidad de desarrollar alternativas para controlar plagas. La alternativa promisoria son los isotiocianatos, cuya potente actividad fungicida ha sido comprobada en diversos hongos incluyendo Alternaria alternata. Sin embargo, después de una exposición crónica, este hongo logra concentraciones subletales de 2-propenil isotiocianato (2-plTC) mediante un mecanismo no elucidado. Con el objetivo de identificar los genes inducidos en A. alternata en respuesta al tratamiento con 2-plTC, se construyó una genoteca sustractiva supresiva utilizando los cDNAs de una cepa tratada como "tester" y los cDNAs de la cepa testigo como "driver". Se aislaron y secuenciaron un total de 102 ESTs (Expressed Sequence Tags, por sus siglas en inglés), los cuales generaron 50 unigenes al realizar el ensamblaje (17 contigs y 33 singlets), El análisis mediante el algoritmo Blastn, reveló que el 20% de los clones fueron similares a secuencias de Alternaria brassicicola inducidas por condiciones similares de nitrógeno. Asimismo, el análisis con el algoritmo Blastx demostró que el 38%, de los unigenes fueron similares a proteínas fúngicas conocidas, el 40% a proteínas hipotéticas y el 18% no presentaron similitud con secuencias conocidas. La comparación a nivel nucleotídico de los unigenes con el genoma de A. brassicicola, reveló que el 90%,fueron similares a secuencias de este hongo, mientras que el 10%, correspondió a secuencias no reportadas. A nivel de nucleotidos, el 92% fue significativamente similar a proteínas de A. brassicicola mientras que el 8%, correspondió a proteínas no reportadas.
2009
Tesis de doctorado
Español
Público en general
HIBRIDACIÓN
Versión publicada
publishedVersion - Versión publicada
Aparece en las colecciones: TESIS DE DOCTORADO EN CIENCIAS (DC)

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