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Variación genética del gen ORF5 del virus del síndrome reproductivo y respiratorio porcino (PRRSV) en el estado de Sonora
ALEXEL JESUS BURGARA ESTRELLA
JESUS HERNANDEZ LOPEZ
ROGERIO RAFAEL SOTELO MUNDO
VERONICA MATA HARO
CARLOS ARTURO VELAZQUEZ CONTRERAS
Acceso Abierto
Atribución-NoComercial-SinDerivadas
NUTRICIÓN
Para investigar las características genéticas del virus del síndrome reproductivo y respiratorio porcino (PRRSV), se determinó la secuencia completa del gen ORF5 de 115 aislados de diferentes granjas ubicadas en Navojoa, Cd. Obregón y Hermosillo, Sonora entre 2003 y 2008. Estas secuencias fueron analizadas independientemente y comparadas con 201 secuencias del tipo americano incluida la referencia VR2332 y 24 del tipo europeo incluida la cepa de referencia Lelystad, disponibles en el banco de genes. La identidad a nivel de nucleótidos de las secuencias sonorenses con las cepas de referencia VR2332 y Lelystad estuvo alrededor del 84-99% y el 53-56% respectivamente. El análisis filogenético obtenido de 73 secuencias por el método Neighbor-Joining, mostró 5 grupos de la A-E, con seis secuencias sin clasificar. No se pudo establecer una relación entre la proximidad de las granjas y la variación de las secuencias. Hubo 4 secuencias con diferencia significativa para la prueba de Fisher's de neutralidad provenientes de cerdos vacunados. Las secuencias sonorenses se ubicaron en 4 de los 5 grupos al compararlas con las secuencias del banco de genes. El 76% de las secuencias sonorenses estuvieron dentro del grupo A y B, mientras que en el grupo C se ubicaron las secuencias de los cerdos vacunados y el grupo E estuvo formado por 5 secuencias de Cd. Obregón. Aquellas secuencias que se relacionaron genéticamente fuera de las sonorenses lo hicieron con cepas estadounidenses y solo dos secuencias no se agruparon.
2008
Tesis de maestría
Español
Público en general
QUÍMICA
Versión publicada
publishedVersion - Versión publicada
Aparece en las colecciones: TESIS DE MAESTRÍA EN CIENCIAS.

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